NCBI 分类学数据库（taxonomy database）不是分类学或系统发育信息的信息源（primary source），而且也没有自己的一套完整的分类学系统，相反它只是努力整合各种各样来源的系统发育和分类学的知识，包括发表的文献、基于网络的数据库、序列提交者的建议以及来自NCBI 外部的分类学专家。因此NCBI 的分类学数据库不是一个系统发育或分类学的“专家数据库”（Wheeler et al., 2000）。 获取序列所对应的分类学信息有两种方法。 一种方法，从NCBI 网站下载gi与taxid 对应表，在Taxonomy 数据库的FTP 地址下载。这个目录下有多个压缩文件，其中针对Windows 操作系统的两个针对蛋白质序列和核苷酸序列的压缩文件分别是gi_taxid_prot.dmp.gz 和gi_taxid_nucl.dmp.gz 文件。这两个文件都只有两列，左边为gi 号，右边为Taxid。由于这些文件非常大，因此用浏览器来打开这些文件几乎是不可能的。随着时间的推移，这两个文件会越来越大，不过速度不会是指数增长的，并且在美国东部时间的每个星期一2：00 am NCBI 会对其进行更新。 对于Windows 用户还有一个文件称为taxdump.zip 文件。文件解压缩后包括1 个*.prt 文件和6 个*.dmp 文件。Gencode.dmp 文件保存有不同的密码子表，与同目录的gc.prt 联合使用；merged.dmp 是保存有合并的taxid 号的对应表；nodes.dmp 是结点信息；division.dmp 是较大的几个分类；names.dmp 结点名称信息，每个id 对应多行。这些数据被Phylogenie 软件包中的blammer 程序用于构建进化树。 利用ftp 地址的连接利用Http 或ftp 方式将文件下载到本地，通过本地程序或脚本搜索文本，来建立gi 号与Taxid 之间的联系（图）。这种方法比较适合于在线服务的Web 形式的程序，通过在本地不断地及时更新程序就可以完成这项工作。 第二种方法是对Taxonomy 数据库进行API 分析。NCBI 用来保存Taxonomy信息的数据库名称为TAXON。
伦敦——一列早班车驶出车站，穿过了海峡。英国的孩子们在一家巴黎酒吧讨论着利物浦的足球队。 一些巴黎人已经出发去伦敦工作。 十九世纪，Charles Dickens在《双城记》一书中比较了伦敦和巴黎这两座城市。但是这几天，应该被称为《单城记》。 由于近几年国内的工作越来越少，约有25万的法国人移民到海峡对面。通过海底隧道，两座城市之间的路程只需3个小时。欧盟也免除了人们自由移民和报关的手续。 巴黎是一座富饶美丽，更是一座时尚的城市。但是伦敦感受到更多的是充实的生活和即使酒吧关门后依然存在的乐趣。 “对于我来说，这两座城市的区别是，伦敦的真实与鲜活。”一位金融专家Trevor Wheeler说。一位专业设计师Chantal Jaouen也表示赞同“我是法国人，但是我生活在伦敦。” 当然，也有其他的观点。Julie Lenoux是一位两年前移民到伦敦的学生，她说“我认为巴黎人民有更多笑容。” “两座城市都有焕然一新的改变。”既是作家，同时也是伦敦人的Larry Collins如是说。 正如大多数了解这两座城市的人一样，他发现这两座城市相处得很融洽。 “在二十世纪五十年代我先爱上了巴黎，那里设备齐全且生活得很好。”但是当然不便宜。 在伦敦的一些地方，租金达到了巴黎Foch街区的两倍多。 对于伦敦和巴黎的选择，就是对一种生活方式的选择。 就像Daphne Benoit（一名法国新闻专业学生，并精通英语），许多年轻人很高兴两座城市很接近，不需要去抉择。 “我爱巴黎，那里有我的邻里们，也有绕着中心的小路，但是生活太规矩了。”她说，“但是在伦敦，你可以做任何你想成为的人，因为没人在乎。”
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